SICU je vjerska ustanova koja djeluje u području kulture i znanosti, a čija je misija sustavno prikupljati, čuvati, štititi, stručno i znanstveno obrađivati te predstavljati sakralnu i umjetničku baštinu. Djelujući u skladu s važećim propisima i muzejskim standardima, SICU promiče kulturnu, umjetničku, povijesnu i crkvenu vrijednost umjetničke građe te je čini dostupnom stručnoj i široj javnosti.

U okviru svoje djelatnosti SICU je specifična crkvena ustanova koju podupiru civilne ustanove.

SICU provodi istraživanja, sudjeluje u zaštiti, konzerviranju i restauriranju umjetnina, izrađuje stručnu dokumentaciju, kataloge i publikacije te sustavno razvija knjižni i dokumentacijski fond. Kroz stalne i povremene izložbe, edukativne programe, radionice, predavanja, stručne skupove i suvremene komunikacijske oblike, SICU interpretira i prezentira svoju građu u stvarnom i virtualnom okruženju.

Vizija SICU je imati značajnu i prepoznatljivu ulogu u promicanju sakralne i umjetničke baštine, otvarajući muzejske prostore svima i potičući aktivno sudjelovanje posjetitelja. SICU nastoji valorizirati i afirmirati sakralnu umjetnosti kao vrijedan dio kulturne baštine te njenu važnost učvrstiti među stručnjacima i širom javnošću. Posebno se zalaže za povezivanje s mladom generacijom, učenicima i studentima, pružajući im iskustvo, znanje i inspiraciju kroz suvremene i edukativne programe, stvarajući prostor za dijalog, kreativnost i trajnu povezanost s kulturnom i crkvenom baštinom.

Glavni cilj je stvaranje prepoznatljive stalne izložbe u Hrvatskoj i svijetu, koji će još više biti atraktivan i dostupan posjetiteljima, te će na jedan suvremen način još više promicati vrijednu hrvatsku sakralnu baštinu. SICU će također širiti svoju mrežu korisnika i stvarati novu publiku kroz suradnju s drugim dionicima u muzejskoj djelatnosti te kroz međusektorsko povezivanje voditi računa o javnom interesu. Vizija u budućnosti je biti vrhunski primjer upravljanja i prezentacije, istraživanja i održivog korištenja vrijedne građe te referentno mjesto za promicanje i pozicioniranje sakralne baštine sa zadarskog područja kroz jačanje svih vidova muzejske djelatnosti te profesionalizaciju muzejskih djelatnika na lokalnoj, nacionalnoj i međunarodnoj razini.